Protein–RNA interactions for Protein: P59729

Rin3, Ras and Rab interactor 3, mousemouse

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rin3P59729 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rin3P59729 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rin3P59729 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Gcnt4-201ENSMUST00000171324 5087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Gpd2-202ENSMUST00000112618 5759 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rin3P59729 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rin3P59729 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rin3P59729 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Tmem8b-203ENSMUST00000107866 4998 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Rin3P59729 Msgn1-201ENSMUST00000049877 613 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms