Protein–RNA interactions for Protein: P59055

Csrnp3, Cysteine/serine-rich nuclear protein 3, mousemouse

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Length 597 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csrnp3P59055 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Unc119b-201ENSMUST00000060798 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Egr2-203ENSMUST00000127820 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Rnf10-203ENSMUST00000112097 3476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Apbb1-213ENSMUST00000189265 1429 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Cabp7-201ENSMUST00000009219 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Xylb-201ENSMUST00000039610 3383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Angel2-203ENSMUST00000110899 3673 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Sall4-202ENSMUST00000075044 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Ino80-202ENSMUST00000110808 3928 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Csrnp3P59055 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms