Protein–RNA interactions for Protein: P59048

Pdrg1, p53 and DNA damage-regulated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdrg1P59048 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Cbfa2t3-201ENSMUST00000006525 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Slc44a3-201ENSMUST00000039197 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pdrg1P59048 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms