Protein–RNA interactions for Protein: P58466

Ctdsp1, Carboxy-terminal domain RNA polymerase II polypeptide A small phosphatase 1, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdsp1P58466 Pxylp1-203ENSMUST00000119141 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Srl-201ENSMUST00000023161 5000 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Pgghg-201ENSMUST00000079403 2981 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Tsku-206ENSMUST00000179780 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Tjap1-211ENSMUST00000225080 2412 ntAPPRIS P2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Dnm1-214ENSMUST00000201433 3146 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm37844-201ENSMUST00000192473 4097 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Zbtb4-202ENSMUST00000108639 7811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Irf7-203ENSMUST00000106023 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm28230-201ENSMUST00000053932 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Rasl12-202ENSMUST00000165682 1903 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Repin1-201ENSMUST00000009420 3145 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Plekhb1-201ENSMUST00000079176 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 5730409E04Rik-201ENSMUST00000097886 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Pcdha11-203ENSMUST00000192447 4583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Cacna1g-204ENSMUST00000107785 7523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Nfat5-201ENSMUST00000075922 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Eif1ad-201ENSMUST00000025759 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Pelp1-201ENSMUST00000019065 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Slc39a2-201ENSMUST00000047726 2334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Rabep2-201ENSMUST00000106405 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Ltbp4-203ENSMUST00000118583 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Dmkn-205ENSMUST00000165887 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Acin1-216ENSMUST00000141453 2381 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Ctdsp1P58466 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms