Protein–RNA interactions for Protein: P58391

Kcnn3, Small conductance calcium-activated potassium channel protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 732 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnn3P58391 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Rps13-ps1-201ENSMUST00000183478 538 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Nos1ap-202ENSMUST00000160456 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
Kcnn3P58391 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Hnf4a-201ENSMUST00000018094 4356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Kcnn3P58391 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms