Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Haghl-203ENSMUST00000133071 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Gm12151-201ENSMUST00000121374 290 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Cldn14-204ENSMUST00000169391 1456 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Cend1-204ENSMUST00000164387 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Ifng-201ENSMUST00000068592 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Gp1bbP56400 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.8 ms