Protein–RNA interactions for Protein: P56399

Usp5, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp5P56399 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp5P56399 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp5P56399 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp5P56399 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp5P56399 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp5P56399 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp5P56399 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp5P56399 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Usp5P56399 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp5P56399 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp5P56399 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp5P56399 AC131743.5-201ENSMUST00000220775 1618 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp5P56399 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Usp5P56399 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.7 ms