Protein–RNA interactions for Protein: P53808

Pctp, Phosphatidylcholine transfer protein, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PctpP53808 Lrrc56-202ENSMUST00000070458 2502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PctpP53808 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PctpP53808 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PctpP53808 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PctpP53808 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PctpP53808 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PctpP53808 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PctpP53808 Col25a1-201ENSMUST00000080335 2624 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PctpP53808 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PctpP53808 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PctpP53808 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Plch2-208ENSMUST00000145662 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Ptn-202ENSMUST00000201321 2558 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PctpP53808 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PctpP53808 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PctpP53808 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PctpP53808 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PctpP53808 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PctpP53808 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PctpP53808 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PctpP53808 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PctpP53808 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PctpP53808 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PctpP53808 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PctpP53808 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PctpP53808 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PctpP53808 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PctpP53808 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PctpP53808 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PctpP53808 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PctpP53808 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PctpP53808 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PctpP53808 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PctpP53808 Vps35-201ENSMUST00000034131 3474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PctpP53808 Cad-206ENSMUST00000201838 3153 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
PctpP53808 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
PctpP53808 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
PctpP53808 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Ap2a1-203ENSMUST00000166972 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Armcx1-203ENSMUST00000113197 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
PctpP53808 Rubcn-204ENSMUST00000119810 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms