Protein–RNA interactions for Protein: P53564

Cux1, Homeobox protein cut-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cux1P53564 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux1P53564 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux1P53564 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Nupr1-201ENSMUST00000032961 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux1P53564 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cux1P53564 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux1P53564 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux1P53564 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux1P53564 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cux1P53564 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Gm12341-201ENSMUST00000119724 503 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Six3os1-205ENSMUST00000175913 791 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cux1P53564 AC155286.1-201ENSMUST00000218632 448 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cux1P53564 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms