Protein–RNA interactions for Protein: P51450

Rorc, Nuclear receptor ROR-gamma, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorcP51450 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RorcP51450 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RorcP51450 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RorcP51450 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RorcP51450 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RorcP51450 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RorcP51450 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RorcP51450 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RorcP51450 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RorcP51450 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 Gm27321-201ENSMUST00000185021 205 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RorcP51450 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RorcP51450 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RorcP51450 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RorcP51450 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RorcP51450 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RorcP51450 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RorcP51450 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RorcP51450 Gm25287-201ENSMUST00000103846 110 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RorcP51450 Gm22918-201ENSMUST00000103855 110 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RorcP51450 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RorcP51450 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RorcP51450 Gm27164-201ENSMUST00000184359 723 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RorcP51450 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
RorcP51450 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
RorcP51450 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RorcP51450 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RorcP51450 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RorcP51450 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RorcP51450 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RorcP51450 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RorcP51450 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RorcP51450 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RorcP51450 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RorcP51450 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RorcP51450 Ccnb2-201ENSMUST00000034742 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RorcP51450 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RorcP51450 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RorcP51450 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RorcP51450 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RorcP51450 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RorcP51450 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
RorcP51450 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RorcP51450 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RorcP51450 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RorcP51450 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RorcP51450 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RorcP51450 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RorcP51450 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RorcP51450 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RorcP51450 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RorcP51450 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RorcP51450 Brwd3-202ENSMUST00000101283 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RorcP51450 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RorcP51450 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RorcP51450 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RorcP51450 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
RorcP51450 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RorcP51450 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RorcP51450 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RorcP51450 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RorcP51450 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RorcP51450 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RorcP51450 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
RorcP51450 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RorcP51450 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
RorcP51450 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
RorcP51450 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64 ms