Protein–RNA interactions for Protein: P50207

Hoxc13, Homeobox protein Hox-C13, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc13P50207 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Ccdc88c-204ENSMUST00000223097 1253 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Zpbp2-201ENSMUST00000017339 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Fis1-203ENSMUST00000111097 601 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Fis1-201ENSMUST00000019198 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Hoxc13P50207 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Nfic-207ENSMUST00000221817 1531 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Park7-205ENSMUST00000105676 582 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gm7030-203ENSMUST00000173322 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gm7030-201ENSMUST00000046131 913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 AC154412.1-201ENSMUST00000226540 2786 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Hoxc13P50207 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms