Protein–RNA interactions for Protein: P49935

Ctsh, Pro-cathepsin H, mousemouse

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Length 333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtshP49935 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtshP49935 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CtshP49935 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CtshP49935 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtshP49935 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CtshP49935 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Olfr286-202ENSMUST00000205305 969 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 AC140375.2-201ENSMUST00000225283 584 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Bcat2-202ENSMUST00000120864 1536 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CtshP49935 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtshP49935 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtshP49935 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtshP49935 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtshP49935 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtshP49935 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtshP49935 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtshP49935 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtshP49935 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CtshP49935 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtshP49935 Gm6222-201ENSMUST00000120787 396 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CtshP49935 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtshP49935 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtshP49935 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtshP49935 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CtshP49935 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtshP49935 Ramp3-201ENSMUST00000045374 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtshP49935 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtshP49935 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtshP49935 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtshP49935 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtshP49935 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtshP49935 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtshP49935 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtshP49935 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtshP49935 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtshP49935 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtshP49935 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtshP49935 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CtshP49935 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtshP49935 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtshP49935 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtshP49935 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtshP49935 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtshP49935 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtshP49935 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CtshP49935 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtshP49935 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtshP49935 Pdlim7-203ENSMUST00000069968 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtshP49935 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtshP49935 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
CtshP49935 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtshP49935 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CtshP49935 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtshP49935 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtshP49935 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtshP49935 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtshP49935 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtshP49935 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtshP49935 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtshP49935 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtshP49935 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtshP49935 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtshP49935 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CtshP49935 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CtshP49935 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
CtshP49935 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CtshP49935 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
CtshP49935 H2bfm-201ENSMUST00000059808 1052 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms