Protein–RNA interactions for Protein: P49446

Ptpre, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 699 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpreP49446 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Ighv8-7-201ENSMUST00000194349 297 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PtpreP49446 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Rgs19-204ENSMUST00000108772 779 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Tpd52-206ENSMUST00000121038 849 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Gm35549-203ENSMUST00000204619 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpreP49446 P2rx3-203ENSMUST00000111616 1315 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpreP49446 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpreP49446 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpreP49446 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Klk2-ps-201ENSMUST00000205342 571 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpreP49446 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpreP49446 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PtpreP49446 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
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