Protein–RNA interactions for Protein: P48281

Vdr, Vitamin D3 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VdrP48281 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VdrP48281 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VdrP48281 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VdrP48281 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VdrP48281 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VdrP48281 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VdrP48281 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VdrP48281 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VdrP48281 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VdrP48281 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VdrP48281 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VdrP48281 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VdrP48281 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VdrP48281 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VdrP48281 Ppp1r3d-201ENSMUST00000058678 3267 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VdrP48281 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VdrP48281 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VdrP48281 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VdrP48281 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VdrP48281 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VdrP48281 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VdrP48281 Myo1c-204ENSMUST00000108431 4718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VdrP48281 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VdrP48281 Vwa5b2-203ENSMUST00000100074 2512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VdrP48281 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VdrP48281 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VdrP48281 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VdrP48281 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VdrP48281 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VdrP48281 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VdrP48281 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VdrP48281 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VdrP48281 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VdrP48281 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VdrP48281 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VdrP48281 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VdrP48281 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VdrP48281 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VdrP48281 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VdrP48281 4930558J18Rik-201ENSMUST00000181949 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VdrP48281 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VdrP48281 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VdrP48281 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VdrP48281 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VdrP48281 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VdrP48281 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VdrP48281 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VdrP48281 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
VdrP48281 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VdrP48281 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VdrP48281 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VdrP48281 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VdrP48281 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VdrP48281 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VdrP48281 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VdrP48281 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VdrP48281 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VdrP48281 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VdrP48281 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VdrP48281 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VdrP48281 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VdrP48281 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VdrP48281 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VdrP48281 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms