Protein–RNA interactions for Protein: P48030

Tgfa, Protransforming growth factor alpha, mousemouse

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Length 159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TgfaP48030 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TgfaP48030 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TgfaP48030 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TgfaP48030 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
TgfaP48030 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TgfaP48030 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
TgfaP48030 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Mrpl27-201ENSMUST00000025278 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Fthl17c-201ENSMUST00000075792 850 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Pde7b-206ENSMUST00000170265 1380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Gm15163-201ENSMUST00000120749 1302 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Gm12091-201ENSMUST00000146791 830 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Mettl26-203ENSMUST00000163356 534 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Wfdc2-201ENSMUST00000017867 849 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
TgfaP48030 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms