Protein–RNA interactions for Protein: P43247

Msh2, DNA mismatch repair protein Msh2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 935 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msh2P43247 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Msh2P43247 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Cchcr1-202ENSMUST00000164242 2656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh2P43247 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh2P43247 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh2P43247 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh2P43247 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh2P43247 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Casc3-204ENSMUST00000169695 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Fbxl19-207ENSMUST00000206893 3449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Cfap45-201ENSMUST00000085894 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Msh2P43247 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.2 ms