Protein–RNA interactions for Protein: P42580

Nkx1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nkx1-2P42580 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Trim32-201ENSMUST00000050850 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Gm16029-201ENSMUST00000161643 2427 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Tagap1-201ENSMUST00000063683 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Rinl-206ENSMUST00000209035 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Lipo3-201ENSMUST00000025694 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Rnf4-207ENSMUST00000182709 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Vta1-205ENSMUST00000154132 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Tpm3-205ENSMUST00000121503 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Igha-202ENSMUST00000194738 2540 ntAPPRIS P5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Map2k6-201ENSMUST00000020949 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Nkx1-2P42580 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.9 ms