Protein–RNA interactions for Protein: P41241

Csk, Tyrosine-protein kinase CSK, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CskP41241 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CskP41241 Krt74-201ENSMUST00000088018 1648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
CskP41241 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CskP41241 Tmem82-201ENSMUST00000053263 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CskP41241 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CskP41241 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CskP41241 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CskP41241 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CskP41241 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CskP41241 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CskP41241 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CskP41241 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CskP41241 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CskP41241 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
CskP41241 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
CskP41241 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Xrcc1-201ENSMUST00000063249 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
CskP41241 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CskP41241 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CskP41241 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CskP41241 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
CskP41241 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.03■□□□□ -0
CskP41241 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CskP41241 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CskP41241 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CskP41241 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CskP41241 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CskP41241 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CskP41241 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CskP41241 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CskP41241 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CskP41241 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CskP41241 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CskP41241 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CskP41241 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CskP41241 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CskP41241 Serpinf1-202ENSMUST00000125982 605 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CskP41241 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
CskP41241 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
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CskP41241 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
CskP41241 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CskP41241 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
CskP41241 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CskP41241 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CskP41241 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CskP41241 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CskP41241 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CskP41241 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CskP41241 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
CskP41241 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CskP41241 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CskP41241 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CskP41241 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CskP41241 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
CskP41241 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CskP41241 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CskP41241 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CskP41241 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CskP41241 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CskP41241 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CskP41241 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
CskP41241 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
CskP41241 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.8 ms