Protein–RNA interactions for Protein: P39429

Traf2, TNF receptor-associated factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf2P39429 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf2P39429 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Traf2P39429 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf2P39429 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf2P39429 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf2P39429 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf2P39429 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf2P39429 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf2P39429 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf2P39429 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf2P39429 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf2P39429 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf2P39429 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf2P39429 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf2P39429 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Traf2P39429 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf2P39429 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf2P39429 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf2P39429 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf2P39429 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf2P39429 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf2P39429 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Traf2P39429 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf2P39429 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf2P39429 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.03■□□□□ -0
Traf2P39429 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Traf2P39429 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf2P39429 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf2P39429 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf2P39429 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf2P39429 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf2P39429 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Traf2P39429 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf2P39429 Mtcl1-211ENSMUST00000177034 5441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Traf2P39429 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf2P39429 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Traf2P39429 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf2P39429 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf2P39429 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf2P39429 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf2P39429 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf2P39429 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf2P39429 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Traf2P39429 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf2P39429 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Traf2P39429 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Traf2P39429 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Traf2P39429 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Traf2P39429 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
Traf2P39429 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Traf2P39429 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Traf2P39429 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Traf2P39429 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf2P39429 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC15.02■□□□□ -0
Traf2P39429 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Traf2P39429 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf2P39429 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf2P39429 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Traf2P39429 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Tmprss5-204ENSMUST00000167095 1146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Traf2P39429 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Traf2P39429 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms