Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Zfp683-201ENSMUST00000105884 1471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Flg-208ENSMUST00000180308 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Gm26600-201ENSMUST00000181637 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Mdk-201ENSMUST00000028672 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Gp9-201ENSMUST00000032133 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Gm12329-201ENSMUST00000120829 1007 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprkP35822 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprkP35822 4933434E20Rik-202ENSMUST00000029552 1080 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Olfr569-201ENSMUST00000078191 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Olfr582-201ENSMUST00000098212 960 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Lrif1-202ENSMUST00000098751 929 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
PtprkP35822 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Opn1sw-203ENSMUST00000147483 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Gm7619-201ENSMUST00000210649 1282 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprkP35822 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Cnpy2-201ENSMUST00000026446 763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprkP35822 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Gtf2ird1-208ENSMUST00000167084 3283 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Gm20499-201ENSMUST00000140374 444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprkP35822 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprkP35822 AC121804.3-201ENSMUST00000223420 295 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprkP35822 CT009713.10-202ENSMUST00000225734 696 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprkP35822 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Rnf113a1-201ENSMUST00000046433 1223 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Tmem59l-201ENSMUST00000045286 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprkP35822 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprkP35822 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Gm11661-201ENSMUST00000121761 1327 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Mmgt2-207ENSMUST00000155759 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprkP35822 4930518P08Rik-201ENSMUST00000221281 1187 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Mrps10-202ENSMUST00000119841 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PtprkP35822 Hoxd8-203ENSMUST00000151380 557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.7 ms