Protein–RNA interactions for Protein: P35821

Ptpn1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn1P35821 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Dlgap4-204ENSMUST00000109566 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Eif4g1-206ENSMUST00000115463 5378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ptpn1P35821 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Ptpn1P35821 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms