Protein–RNA interactions for Protein: P35601

Rfc1, Replication factor C subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rfc1P35601 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Serpinh1-205ENSMUST00000208119 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Slc19a2-202ENSMUST00000159230 3432 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Abi2-201ENSMUST00000052332 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Vamp2-201ENSMUST00000021273 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Arhgef25-202ENSMUST00000167353 2189 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Ermard-203ENSMUST00000097393 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Pcyox1l-201ENSMUST00000025472 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Smpd3-202ENSMUST00000212896 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Socs3-201ENSMUST00000054002 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Lin54-201ENSMUST00000046154 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Gm43570-201ENSMUST00000199951 3688 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Etnk2-201ENSMUST00000129213 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Sema4b-204ENSMUST00000205822 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Fstl5-201ENSMUST00000038364 5107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Efemp1-201ENSMUST00000020759 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Rfc1P35601 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms