Protein–RNA interactions for Protein: P35295

Rab20, Ras-related protein Rab-20, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab20P35295 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Ntng1-205ENSMUST00000106575 1620 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Ntng1-202ENSMUST00000072596 1620 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab20P35295 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab20P35295 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Tsc22d1-202ENSMUST00000048371 4818 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Atp2a3-207ENSMUST00000163326 4606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab20P35295 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab20P35295 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab20P35295 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab20P35295 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab20P35295 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Luc7l3-201ENSMUST00000021226 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Rab20P35295 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33 ms