Protein–RNA interactions for Protein: P35235

Ptpn11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, mousemouse

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn11P35235 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Gfpt1-202ENSMUST00000113655 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Dancr-202ENSMUST00000120364 575 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Tmem61-202ENSMUST00000177702 561 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Prr29-203ENSMUST00000185986 983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 5430431A17Rik-201ENSMUST00000206342 795 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Mocs2-207ENSMUST00000166104 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Gm44344-201ENSMUST00000200287 129 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Gstp2-201ENSMUST00000042700 770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ptpn11P35235 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms