Protein–RNA interactions for Protein: P34928

Apoc1, Apolipoprotein C-I, mousemouse

Predictions only

Length 88 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc1P34928 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Ubc-202ENSMUST00000136312 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Dapk1-201ENSMUST00000044083 5304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 1010001N08Rik-201ENSMUST00000180789 1967 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Fbxo3-201ENSMUST00000028603 4740 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Chtop-206ENSMUST00000107344 2972 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Palld-203ENSMUST00000121493 5445 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Trappc12-203ENSMUST00000170994 2818 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC13□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Ctnnd2-203ENSMUST00000226119 4111 ntAPPRIS ALT2 BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Vldlr-207ENSMUST00000167487 7971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Arhgap20-201ENSMUST00000065496 7161 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Apoc1P34928 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms