Protein–RNA interactions for Protein: P33611

Pola2, DNA polymerase alpha subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pola2P33611 Tmem50a-201ENSMUST00000030626 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pola2P33611 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pola2P33611 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pola2P33611 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pola2P33611 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pola2P33611 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pola2P33611 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pola2P33611 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pola2P33611 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pola2P33611 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pola2P33611 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pola2P33611 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pola2P33611 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pola2P33611 Itfg1-201ENSMUST00000034140 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pola2P33611 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pola2P33611 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pola2P33611 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pola2P33611 Trim10-201ENSMUST00000060524 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pola2P33611 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pola2P33611 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pola2P33611 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pola2P33611 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pola2P33611 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pola2P33611 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pola2P33611 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pola2P33611 Thoc7-209ENSMUST00000225325 765 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pola2P33611 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pola2P33611 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pola2P33611 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pola2P33611 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Retreg3-201ENSMUST00000017946 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Ick-203ENSMUST00000117330 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Dse-201ENSMUST00000048010 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Hnrnpa2b1-201ENSMUST00000069949 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Rnf31-201ENSMUST00000019443 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Sema6b-202ENSMUST00000167545 3847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Tcf25-208ENSMUST00000212571 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Pramel1-201ENSMUST00000037419 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Fbxl5-207ENSMUST00000124610 2306 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pola2P33611 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pola2P33611 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Dpp3-201ENSMUST00000025851 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Olfr793-ps1-201ENSMUST00000205161 895 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pola2P33611 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pola2P33611 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Fkbp10-201ENSMUST00000001595 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pola2P33611 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms