Protein–RNA interactions for Protein: P33215

Nedd1, Protein NEDD1, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd1P33215 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Farp2-202ENSMUST00000122402 2816 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Tmem217-202ENSMUST00000168339 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Ropn1l-201ENSMUST00000110408 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Gm8116-201ENSMUST00000182917 1201 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Mbp-204ENSMUST00000080658 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Cyp2t4-201ENSMUST00000108385 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Nedd1P33215 Gm15693-201ENSMUST00000120470 637 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.3 ms