Protein–RNA interactions for Protein: P29341

Pabpc1, Polyadenylate-binding protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pabpc1P29341 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Zfp74-203ENSMUST00000108211 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Eef1akmt2-201ENSMUST00000033257 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Pabpc1P29341 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.7 ms