Protein–RNA interactions for Protein: P28862

Mmp3, Stromelysin-1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp3P28862 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gm14206-201ENSMUST00000132973 747 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Fhad1-201ENSMUST00000036701 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gm27306-201ENSMUST00000183970 107 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Serpina16-201ENSMUST00000095451 1257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Gm6944-201ENSMUST00000182449 1006 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Sergef-201ENSMUST00000033127 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Mmp3P28862 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Mmp3P28862 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms