Protein–RNA interactions for Protein: P28231

Gjb3, Gap junction beta-3 protein, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb3P28231 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Dph3-205ENSMUST00000124303 809 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Arhgef25-201ENSMUST00000019611 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Gjb3P28231 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Gm27920-201ENSMUST00000183953 96 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Gjb3P28231 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms