Protein–RNA interactions for Protein: P27870

Vav1, Proto-oncogene vav, mousemouse

Predictions only

Length 845 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vav1P27870 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Sox17-201ENSMUST00000027035 3127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav1P27870 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Tubgcp4-215ENSMUST00000186659 2915 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Brd2-203ENSMUST00000114242 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Irs3-201ENSMUST00000057314 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Vav1P27870 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms