Protein–RNA interactions for Protein: P27661

H2afx, Histone H2AX, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2afxP27661 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Ilvbl-201ENSMUST00000105384 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Kcna5-201ENSMUST00000060972 2862 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
H2afxP27661 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afxP27661 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Gm44065-201ENSMUST00000203184 3527 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Dpysl4-202ENSMUST00000121184 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Fgfr3-210ENSMUST00000169212 4245 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Zfp672-204ENSMUST00000108829 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Trim32-202ENSMUST00000107366 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Lrfn2-201ENSMUST00000046254 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Xrcc3-201ENSMUST00000021715 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afxP27661 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Gm16685-201ENSMUST00000181286 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Syngap1-202ENSMUST00000177932 3927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Pbx3-202ENSMUST00000113132 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Ggt7-201ENSMUST00000029131 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afxP27661 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
H2afxP27661 Gpt-201ENSMUST00000023203 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms