Protein–RNA interactions for Protein: P27546

Map4, Microtubule-associated protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map4P27546 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Map4P27546 Ndufv3-205ENSMUST00000191598 642 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Map4P27546 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Map4P27546 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Map4P27546 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Map4P27546 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Map4P27546 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Map4P27546 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Map4P27546 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Map4P27546 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Map4P27546 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Map4P27546 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Map4P27546 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Map4P27546 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Map4P27546 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Map4P27546 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Map4P27546 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Map4P27546 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Map4P27546 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Map4P27546 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Map4P27546 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Map4P27546 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Map4P27546 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Map4P27546 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Map4P27546 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Map4P27546 Rpl17-ps10-201ENSMUST00000119383 555 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Map4P27546 Rpl17-ps9-201ENSMUST00000119541 555 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Map4P27546 Rpl17-ps4-201ENSMUST00000120241 555 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Map4P27546 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Map4P27546 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Map4P27546 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Map4P27546 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Map4P27546 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Map4P27546 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Map4P27546 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Map4P27546 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Map4P27546 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Map4P27546 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Map4P27546 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Map4P27546 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Map4P27546 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Map4P27546 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Map4P27546 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Map4P27546 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Map4P27546 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Map4P27546 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Map4P27546 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Map4P27546 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Map4P27546 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Map4P27546 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Map4P27546 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Map4P27546 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Map4P27546 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Map4P27546 1700110K17Rik-202ENSMUST00000156511 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Map4P27546 Gstt1-201ENSMUST00000001713 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Map4P27546 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Map4P27546 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Map4P27546 AC135669.1-201ENSMUST00000213585 412 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Map4P27546 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Map4P27546 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Map4P27546 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Map4P27546 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Map4P27546 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Map4P27546 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Map4P27546 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Map4P27546 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Map4P27546 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Map4P27546 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Map4P27546 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Map4P27546 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Map4P27546 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Map4P27546 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Map4P27546 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Map4P27546 Stra8-202ENSMUST00000114997 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Map4P27546 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Map4P27546 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Map4P27546 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Map4P27546 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Map4P27546 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Map4P27546 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Map4P27546 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Map4P27546 Kdm2a-202ENSMUST00000075856 7242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Map4P27546 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Map4P27546 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Map4P27546 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Map4P27546 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Map4P27546 2610028D06Rik-201ENSMUST00000215216 1713 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Map4P27546 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map4P27546 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map4P27546 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map4P27546 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map4P27546 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map4P27546 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map4P27546 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map4P27546 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map4P27546 Baiap2l2-205ENSMUST00000170955 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map4P27546 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Map4P27546 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map4P27546 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Map4P27546 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms