Protein–RNA interactions for Protein: P26361

Cftr, Cystic fibrosis transmembrane conductance regulator, mousemouse

Predictions only

Length 1,476 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CftrP26361 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CftrP26361 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CftrP26361 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CftrP26361 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CftrP26361 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CftrP26361 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CftrP26361 Gm8062-201ENSMUST00000139696 444 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CftrP26361 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CftrP26361 1700122O11Rik-201ENSMUST00000178823 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CftrP26361 Gm11427-203ENSMUST00000215482 1203 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CftrP26361 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CftrP26361 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CftrP26361 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CftrP26361 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CftrP26361 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CftrP26361 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
CftrP26361 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CftrP26361 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CftrP26361 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CftrP26361 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CftrP26361 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CftrP26361 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CftrP26361 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
CftrP26361 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CftrP26361 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CftrP26361 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
CftrP26361 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
CftrP26361 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CftrP26361 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CftrP26361 Myl3-203ENSMUST00000136695 614 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CftrP26361 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CftrP26361 Ly6g6e-203ENSMUST00000172678 750 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
CftrP26361 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CftrP26361 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CftrP26361 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CftrP26361 Nat6-201ENSMUST00000093785 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CftrP26361 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
CftrP26361 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CftrP26361 Trim11-203ENSMUST00000108810 2301 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CftrP26361 Gm12742-201ENSMUST00000117326 410 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
CftrP26361 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CftrP26361 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CftrP26361 Gm3893-201ENSMUST00000178882 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
CftrP26361 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CftrP26361 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CftrP26361 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CftrP26361 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CftrP26361 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CftrP26361 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CftrP26361 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CftrP26361 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CftrP26361 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CftrP26361 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CftrP26361 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CftrP26361 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
CftrP26361 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CftrP26361 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CftrP26361 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CftrP26361 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CftrP26361 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CftrP26361 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CftrP26361 3110053B16Rik-204ENSMUST00000145605 575 ntBASIC24.83■■□□□ 1.56
CftrP26361 Rpl13a-201ENSMUST00000150350 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CftrP26361 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CftrP26361 Gm11214-201ENSMUST00000184252 552 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CftrP26361 Gm20219-201ENSMUST00000209718 1269 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
CftrP26361 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
CftrP26361 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CftrP26361 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CftrP26361 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CftrP26361 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CftrP26361 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CftrP26361 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CftrP26361 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CftrP26361 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CftrP26361 Gm44799-201ENSMUST00000207639 1202 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
CftrP26361 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CftrP26361 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CftrP26361 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CftrP26361 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
CftrP26361 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
CftrP26361 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CftrP26361 Nfkbia-201ENSMUST00000021413 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CftrP26361 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CftrP26361 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CftrP26361 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CftrP26361 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CftrP26361 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CftrP26361 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CftrP26361 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CftrP26361 Aurkaip1-202ENSMUST00000105591 773 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.81■■□□□ 1.56
CftrP26361 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CftrP26361 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CftrP26361 Gm45784-201ENSMUST00000188360 142 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CftrP26361 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CftrP26361 Fars2-202ENSMUST00000099582 962 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CftrP26361 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CftrP26361 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
CftrP26361 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
CftrP26361 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms