Protein–RNA interactions for Protein: P23819

Gria2, Glutamate receptor 2, mousemouse

Predictions only

Length 883 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gria2P23819 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria2P23819 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria2P23819 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria2P23819 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria2P23819 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria2P23819 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria2P23819 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Gria2P23819 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria2P23819 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria2P23819 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria2P23819 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria2P23819 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria2P23819 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria2P23819 Dnajc7-201ENSMUST00000014339 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria2P23819 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria2P23819 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria2P23819 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria2P23819 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria2P23819 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria2P23819 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria2P23819 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria2P23819 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria2P23819 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria2P23819 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria2P23819 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria2P23819 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria2P23819 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria2P23819 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria2P23819 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria2P23819 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria2P23819 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria2P23819 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Gria2P23819 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria2P23819 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Gm18737-201ENSMUST00000173594 937 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Osr2-201ENSMUST00000022952 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria2P23819 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Sept8-202ENSMUST00000117061 4563 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Gm11543-201ENSMUST00000120758 370 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Rps10-ps2-201ENSMUST00000127484 496 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria2P23819 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Gria2P23819 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gria2P23819 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.4 ms