Protein–RNA interactions for Protein: P23591

Tsta3, GDP-L-fucose synthase, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tsta3P23591 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Tsta3P23591 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Tsta3P23591 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms