Protein–RNA interactions for Protein: P23463

Hoxd8, Homeobox protein Hox-D8, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd8P23463 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 1810014B01Rik-201ENSMUST00000181587 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Aen-201ENSMUST00000107421 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Hist1h4d-201ENSMUST00000102968 1138 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gm4204-201ENSMUST00000110798 1231 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 AC156016.3-201ENSMUST00000228623 344 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Zdhhc19-201ENSMUST00000064192 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gm6263-201ENSMUST00000120029 1342 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Hfe-201ENSMUST00000006787 516 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Hfe-203ENSMUST00000091707 816 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 A930015D03Rik-201ENSMUST00000173900 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 AC161424.1-202ENSMUST00000213570 767 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Tmem107-201ENSMUST00000075980 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Hoxd8P23463 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms