Protein–RNA interactions for Protein: P21952

Pou3f1, POU domain, class 3, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou3f1P21952 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Lamp2-201ENSMUST00000016678 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Tmem94-201ENSMUST00000093912 5329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Smoc2-201ENSMUST00000024660 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pou3f1P21952 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Sptlc1-201ENSMUST00000021920 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pou3f1P21952 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms