Protein–RNA interactions for Protein: P21841

Sftpc, Pulmonary surfactant-associated protein C, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SftpcP21841 Trbc2-201ENSMUST00000103299 692 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Gm11773-201ENSMUST00000138256 497 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 2410002F23Rik-214ENSMUST00000186606 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 2810408A11Rik-202ENSMUST00000100969 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SftpcP21841 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Gm28631-201ENSMUST00000190740 334 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SftpcP21841 4930593C16Rik-202ENSMUST00000214011 714 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Cct4-204ENSMUST00000173867 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Tm7sf2-209ENSMUST00000161528 732 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Ccer2-201ENSMUST00000178767 1054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Lce1g-201ENSMUST00000029527 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
SftpcP21841 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms