Protein–RNA interactions for Protein: P20801

Tnnc2, Troponin C, skeletal muscle, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnnc2P20801 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Tnnc2P20801 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Sirpa-213ENSMUST00000163034 677 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Idh2-207ENSMUST00000206714 392 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Ndufs6-204ENSMUST00000223293 757 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tnnc2P20801 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms