Protein–RNA interactions for Protein: P19253

Rpl13a, 60S ribosomal protein L13a, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl13aP19253 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Arvcf-201ENSMUST00000090103 4620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Ptprt-203ENSMUST00000109443 12112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Urgcp-202ENSMUST00000093362 5089 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Dlgap3-201ENSMUST00000046659 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Cbln3-201ENSMUST00000063871 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Elmsan1-201ENSMUST00000046266 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Nipa2-204ENSMUST00000119201 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Nsd3-206ENSMUST00000142395 10105 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Atp2b2-203ENSMUST00000101045 8877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.91□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Cux2-210ENSMUST00000168288 4697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 P2rx6-201ENSMUST00000023441 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Dnmbp-202ENSMUST00000212032 5074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Rpl13aP19253 Phf24-202ENSMUST00000107975 6494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms