Protein–RNA interactions for Protein: P18653

Rps6ka1, Ribosomal protein S6 kinase alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps6ka1P18653 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Mxra8os-201ENSMUST00000097740 687 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Rbfox3-201ENSMUST00000017576 3150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Bcs1l-201ENSMUST00000027358 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Chodl-201ENSMUST00000023568 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rps6ka1P18653 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 F11r-201ENSMUST00000043839 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Mcc-202ENSMUST00000164666 3606 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Dffa-202ENSMUST00000103216 1835 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Slc35c2-204ENSMUST00000109300 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Clcnka-201ENSMUST00000042617 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rps6ka1P18653 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms