Protein–RNA interactions for Protein: P17918

Pcna, Proliferating cell nuclear antigen, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PcnaP17918 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcnaP17918 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Gm9856-201ENSMUST00000217077 2578 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcnaP17918 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcnaP17918 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Itgb1-201ENSMUST00000090006 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Rragb-201ENSMUST00000039720 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcnaP17918 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcnaP17918 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Ror2-201ENSMUST00000021918 3985 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcnaP17918 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcnaP17918 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcnaP17918 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcnaP17918 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Ybx1-201ENSMUST00000079644 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PcnaP17918 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.3 ms