Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP11369 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP11369 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP11369 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP11369 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP11369 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP11369 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP11369 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP11369 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP11369 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP11369 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP11369 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP11369 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP11369 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP11369 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP11369 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP11369 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PolP11369 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP11369 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP11369 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP11369 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP11369 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP11369 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP11369 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP11369 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP11369 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP11369 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP11369 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP11369 Gm10244-202ENSMUST00000156905 474 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP11369 Pdzd11-201ENSMUST00000015812 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP11369 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP11369 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP11369 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP11369 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP11369 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP11369 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP11369 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP11369 Acat3-201ENSMUST00000043923 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP11369 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP11369 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP11369 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP11369 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP11369 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP11369 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP11369 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PolP11369 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PolP11369 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PolP11369 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PolP11369 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PolP11369 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PolP11369 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PolP11369 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PolP11369 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PolP11369 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PolP11369 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PolP11369 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PolP11369 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PolP11369 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PolP11369 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PolP11369 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PolP11369 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PolP11369 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
PolP11369 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PolP11369 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PolP11369 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
PolP11369 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PolP11369 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PolP11369 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PolP11369 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PolP11369 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
PolP11369 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP11369 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP11369 Gnpda2-202ENSMUST00000120789 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP11369 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP11369 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP11369 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP11369 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP11369 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP11369 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP11369 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP11369 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP11369 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP11369 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP11369 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP11369 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP11369 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP11369 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP11369 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP11369 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP11369 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP11369 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP11369 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP11369 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP11369 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP11369 Pdzd4-202ENSMUST00000114438 3625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP11369 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PolP11369 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PolP11369 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PolP11369 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PolP11369 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms