Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Hectd4-201ENSMUST00000042614 15482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Unc93b1-204ENSMUST00000165711 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Marveld2-203ENSMUST00000168772 1888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Unc5b-203ENSMUST00000218637 3653 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Mfsd6-201ENSMUST00000087701 3493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Sidt1-205ENSMUST00000136381 4404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Ppp1r1b-206ENSMUST00000150762 1801 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Rims1-206ENSMUST00000115273 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Megf10-201ENSMUST00000075770 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Ankrd35-201ENSMUST00000048427 4052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Gm45003-201ENSMUST00000205875 2158 ntBASIC5.99□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Olfml3-201ENSMUST00000029440 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Shc4-203ENSMUST00000110480 3671 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Prkcq-201ENSMUST00000028118 3583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Nrd1-201ENSMUST00000065977 4311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Baiap3-202ENSMUST00000182056 4645 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Rnpepl1-201ENSMUST00000027487 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Gns-201ENSMUST00000040344 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Amhr2-201ENSMUST00000023809 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Hhip-201ENSMUST00000079038 9074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Tnp1P10856 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC5.98□□□□□ -1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms