Protein–RNA interactions for Protein: P10628

Hoxd4, Homeobox protein Hox-D4, mousemouse

Predictions only

Length 250 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd4P10628 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Klhl12-203ENSMUST00000116528 3277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 A530083I20Rik-201ENSMUST00000180486 2421 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Zfp747-201ENSMUST00000067425 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Bhmt2-201ENSMUST00000015941 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Slc45a1-201ENSMUST00000037827 3387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Dlgap1-202ENSMUST00000097288 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Nrg1-210ENSMUST00000208488 2403 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Myo1c-201ENSMUST00000069057 4547 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Gm42769-201ENSMUST00000198576 1659 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Gins3-201ENSMUST00000034094 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Sgms1-212ENSMUST00000151289 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Adad1-203ENSMUST00000144629 3101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Tle3-210ENSMUST00000161207 2592 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Mindy3-201ENSMUST00000028105 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Slc39a3-202ENSMUST00000117276 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Peli1-201ENSMUST00000093290 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Tdg-208ENSMUST00000151390 3502 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 App-204ENSMUST00000227021 3264 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Hoxd4P10628 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.8 ms