Protein–RNA interactions for Protein: P0DP43

Catspere, Cation channel sperm-associated protein subunit epsilon, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatspereP0DP43 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Cbfb-203ENSMUST00000109394 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Gm15862-201ENSMUST00000146349 361 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 1700021F05Rik-202ENSMUST00000147196 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 AC154767.3-201ENSMUST00000225150 1342 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
CatspereP0DP43 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms