Protein–RNA interactions for Protein: P0DOY1

Dnmt3c, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3C, mousemouse

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Length 709 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3cP0DOY1 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Aggf1-201ENSMUST00000022189 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Dnmt3cP0DOY1 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Dnmt3cP0DOY1 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Dnmt3cP0DOY1 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Mfsd6l-201ENSMUST00000053211 2060 ntAPPRIS P1 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Dnmt3cP0DOY1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 AC162938.1-201ENSMUST00000213140 2323 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Nupl1-207ENSMUST00000225311 2475 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Cbarp-215ENSMUST00000170219 2941 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Atg9a-208ENSMUST00000189702 4110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Dnmt3cP0DOY1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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