Protein–RNA interactions for Protein: P09027

Hoxd3, Homeobox protein Hox-D3, mousemouse

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Length 433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd3P09027 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Gm20825-201ENSMUST00000178149 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Id2-201ENSMUST00000020974 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Gm18363-201ENSMUST00000221671 730 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Slc31a2-203ENSMUST00000107468 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Gm13263-201ENSMUST00000121271 838 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Gm29520-201ENSMUST00000191209 1067 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Gm31409-201ENSMUST00000209894 710 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Gm29909-201ENSMUST00000214500 922 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 AC163354.1-207ENSMUST00000221270 1243 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Iqck-202ENSMUST00000106547 2026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Trafd1-202ENSMUST00000120784 2425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Stard3nl-209ENSMUST00000221380 1268 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 CT010486.3-201ENSMUST00000224555 811 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Tst-201ENSMUST00000058659 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Hsd17b7-202ENSMUST00000111353 1446 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Nfya-206ENSMUST00000160319 1407 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Hoxd3P09027 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
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