Protein–RNA interactions for Protein: P06804

Tnf, Tumor necrosis factor, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnfP06804 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TnfP06804 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TnfP06804 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TnfP06804 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TnfP06804 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TnfP06804 Ubap1l-201ENSMUST00000147185 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TnfP06804 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TnfP06804 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TnfP06804 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TnfP06804 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TnfP06804 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TnfP06804 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TnfP06804 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TnfP06804 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TnfP06804 Rtl8c-201ENSMUST00000063384 401 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TnfP06804 Upk1a-201ENSMUST00000006476 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TnfP06804 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TnfP06804 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TnfP06804 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TnfP06804 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TnfP06804 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TnfP06804 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TnfP06804 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Gm3373-202ENSMUST00000177556 1955 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Gm3500-201ENSMUST00000177986 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Sesn3-201ENSMUST00000034507 1827 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Mbl1-202ENSMUST00000225792 1563 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Hsd17b14-201ENSMUST00000107752 1400 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Commd9-201ENSMUST00000028584 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Klk1-201ENSMUST00000075162 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Catip-204ENSMUST00000191010 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Itgb4-201ENSMUST00000021107 6014 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TnfP06804 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnfP06804 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TnfP06804 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnfP06804 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnfP06804 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnfP06804 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnfP06804 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnfP06804 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnfP06804 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TnfP06804 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnfP06804 Gata1-201ENSMUST00000033502 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnfP06804 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnfP06804 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TnfP06804 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnfP06804 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnfP06804 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnfP06804 Gm9824-201ENSMUST00000178707 561 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TnfP06804 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnfP06804 4933437G19Rik-201ENSMUST00000197910 1178 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
TnfP06804 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnfP06804 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnfP06804 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnfP06804 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnfP06804 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnfP06804 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnfP06804 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnfP06804 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnfP06804 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnfP06804 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnfP06804 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnfP06804 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
TnfP06804 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.1 ms